Cette histoire de miracles et d’amour tourne autour de Mitsuha et Taki. Mitsuha est une lycéenne qui vit dans une ville rurale nichée au cœur des montagnes.

Son père étant maire, il n’est pas souvent à la maison. Elle vit avec sa petite sœur, qui est en âge de fréquenter l’école primaire, et sa grand-mère. Mitsuha a une personnalité honnête, mais elle n’aime pas les coutumes du sanctuaire Shinto de sa famille, ni la participation de son père à une campagne électorale.

Elle regrette de vivre dans une ville rurale confinée et aspire au mode de vie extraordinaire de Tokyo. Taki est un lycéen qui vit dans le centre de Tokyo. Il passe du temps avec ses amis, travaille à temps partiel dans un restaurant italien et s’intéresse à l’architecture et aux beaux-arts.

Un jour, Mitsuha fait un rêve dans lequel elle est un jeune homme. Taki fait également un rêve dans lequel il est une lycéenne dans une ville de montagne où il n’est jamais allé. Quel est le secret de leurs rêves d’expérience personnelle ?