Après la fin de l’opération d’extermination de la famille Tsukiyama, les membres de la Commission de lutte contre les goules (CCG) ont vu leur pouvoir augmenter de façon significative et poursuivent leur objectif d’exterminer toutes les goules du Japon.

Après avoir quitté l’équipe Quinx, Haise Sasaki, qui semble désormais dépourvu d’émotions, commence à accepter de plus en plus de tâches pour la GCC, sans se soucier de la difficulté.

Contrairement à ses expressions vides, la mémoire de Ken Kaneki refait surface dans Haise, le laissant dans un état de conflit interne.

Parallèlement, son nouveau comportement froid affecte les personnes qui l’entourent. Les membres de l’équipe Quinx sont en plein désarroi et doivent faire face à la mort d’un de leurs membres sans le soutien de leur ancien mentor.

Dans ce contexte, l’escouade Quinx et Haise sont obligés de continuer à remplir leurs obligations envers le GCC, de gré ou de force. Toutefois, Haise a appris la présence d’un groupe mystérieux derrière le GCC, et certaines rumeurs de corruption ont également été entendues par l’escouade Quinx.